確定申告書できたけど

源泉徴収された収入が有ります。
今回は例年と違い譲渡損が有ります。
国税庁のホームページから、確定申告書の作成です。
取り扱っている会社が違う特定口座二つ有ります。
譲渡損の繰り越し控除を受けるには申告分離課税を選択しなければならないと書いてありますが、一つは総合課税、譲渡損が生じた口座は申告分離課税で良いのだろうか？
ユーチューブなどでも勉強しましたが、よく解りません。
収入が少ないので基本、総合課税を選択したい。
入力していてエラーが出なかったので問題ないと思うけど、今回は郵送でなく税務署に出向いてチェックを受けてから提出しよう。